С одной стороны, аппарат испанских чиновников во время империи мало чем отличался от аналогичных в других европейских государствах той эпохи. Тем не менее, в нем были должности, которые характерны исключительно для Испании.
Кроме того, были и отдельные государственные учреждения для управления колониями, которые делились на отвечающие за общие вопросы и судебную власть и за отвечающие за движение товаров из колоний в Испанию и обратно. В них было полное государственное регулирование.
Однако многовекторность государственного управления сокращала возможность контроля, а значит увеличивала возможность чиновничьей наживы в качестве взяток, то есть коррупции. Кроме того, в «золотом веке» коррупция особенно разрослась в силу поступления в страну огромного количества денег.
Банальное воровство, желание людей в легкой наживе и взятках, чтобы решить вопрос, по мнению историков, стали основными причинами падения Испанской империи. При этом, чтобы искоренить взяточничество государство предпринимала серьезные попытки, но они были безуспешны.