Федор Моргун достиг совершеннолетия к середине Великой Отечественной войны, получил три ранения, был награжден множественными медалями и тремя орденами, а после войны вернулся в родную Украину и поступил в Днепропетровский сельскохозяйственный институт. В дальнейшем он активно продвигался по карьерной лестнице, а в 1952 году вступил в партию КПСС. Когда же Федор Моргун отправился в Казахстан, где начал внедряю природоохранные технологии обработки почвы.
Позже Федор Моргун уехал в Киргизию, где стал первым заместителем председателя Совета Министров республики и, а позже, в 1970х годах начался его взлет политической карьеры уже в Украине. В частности, Федор Моргун стал первым секретарем Полтавского обкома коммунистической партии Украины, а потом оказался главным конкурентом Михаила Горбачева на пост секретаря ЦК КПСС по аграрным вопросам.
Когда Горбачев оказался на высоте в 1980х годах, Моргун уже возглавлял Государственный комитет СССР по охране природы, что также было весьма большой должностью. Летом 1989 года Федор Моргун выступил с резкой критикой принятой Политбюро ЦК КПСС и Советом Министров программы строительства заводов по производству искусственного кормового белка из парафина нефти. Считается, что именно это выступление Моргуну «не простили».
Уже на следующий день Федору Моргуну предложили подать в отставку и, это несмотря на то, что вскоре высокопоставленные чины убедились в рациональности проекта по строительству заводов. В 1989 году Федор Моргун стал пенсионером всесоюзного значения, но продолжал работать — был советником белгородского и полтавского губернаторов по аграрным вопросам, а также писал книги и участвовал в парламентских выборах в Украине.
Федор Моргун погиб 7 июля 2008 года в серьезной автомобильной катастрофе, котора произошла на Сумщине под Ахтырской. Стоит отметить, что и после гибели, результаты деятельности Моргуна давали о себе знать. Так, в 2009 году на 90% пахотных земель Полтавской области его система давала свои плоды, приводя к получению самого большого урожая зерновых за всю историю региона.